Au 1er siècle ap. JC., la
montée du pouvoir romain menace les frontières égyptiennes. Ptolémées XII tient les Romains à distance par sa diplomatie. Son successeur, Cléopâtre VII , tente d’éviter les conquêtes par des
alliances et des complots amoureux, avec Jules César, puis avec Marc Antoine. L’assassinat de César est suivi d’une guerre civile, d’abord entre ses adeptes et les assassins, puis entre Octave,
neveu adoptif de César, et son ancien allié Marc Antoine. Octave écrase les forces alliées d’Antoine et Cléopâtre à Actium, sur la côte grecque, et s’empare d’Alexandrie en 30 av. JC. Après le
suicide d’Antoine et Cléopâtre, l’Egypte est annexée à l’empire romain ; elle restera province romaine pendant les sept siècles qui suivront. Le christianisme est introduit par saint Marc en
45 ap. JC., mais avec la division de l’empire en deux en 379 ap. JC., celui de l’est et celui de l’ouest, l’Egypte passe sous la loi de Constantinople, capitale de l’empire romain d’Orient (Byzance).